全自動菌落計數(shù)器利用其強大軟件圖像處理功能和科學的數(shù)學分析方法對微生物菌落分析和微顆粒粒度檢測，計數(shù)準確，統(tǒng)計速度快，適合醫(yī)院、科研院所、衛(wèi)生防疫站、疾病控制中心、檢驗檢疫、質(zhì)量技術監(jiān)督、環(huán)境檢測機構(gòu)以及制藥、食品飲料、醫(yī)療衛(wèi)生用品行業(yè)等的微生物檢測。

　　分析軟件是計數(shù)儀的另一塊核心成分，因為菌落生物的存在多樣性，在培養(yǎng)基上的表現(xiàn)或顯像不可能大體一致，針對這類變化，在分析軟件選型上要考慮，對于各類成像干擾的自動排出能力。對于嚴重粘連在一起的團裝、鏈狀分布菌落，將其自動分割開來的水平，也是評價分析軟件的考量指標，具有圖像處理、圖像編輯、統(tǒng)計功能、測量功能、數(shù)據(jù)庫管理、以及對抗生素效價分析、藥敏分析功能、多培養(yǎng)皿統(tǒng)計、螺旋平皿統(tǒng)計等一系列功能。

　　全自動菌落計數(shù)器可以對微生物的菌落計數(shù)和計算、抗生素的抗菌性測試和菌種篩選等，菌落是指細菌在固體培養(yǎng)基上生長繁殖而形成的能被肉眼識別的生長物，它是由數(shù)以萬計相同的細菌集合而成。菌落總數(shù)具有兩個方面的食品意義，其一作為食品被污染，及清潔狀況的標志；其二可用來預測食品的可能存放的期限。在測定過程中應注意以下幾個方面：

　　1、培養(yǎng)溫度。不同食品含有細菌種類不同，即引起食品新鮮度下降的細菌種類不同。溫度不同，細菌生長速度不一樣，通常將細菌按生長溫度的要求劃分為嗜冷菌、嗜溫菌和嗜熱菌。

　　2、培養(yǎng)時間。根據(jù)不同類型的細菌，其培養(yǎng)時間也不相同。

　　3、樣品中細菌要均勻分布。在進行樣品稀釋時，必須充分地混勻樣品，否則檢驗結(jié)果有較大的差異。

　　4、不是所有的食品都規(guī)定有細菌總數(shù)指標。

　　5、細菌總數(shù)反映的不是食品中全部的微生物。自然界中的細菌種類很多，各種細菌的生理特征和所要求的生活條件不盡相同，但異養(yǎng)、中溫、好氣性細菌占多數(shù)。所以實際工作中只用一種常用的營養(yǎng)瓊脂來測定樣品中的菌落數(shù)。因此，嚴格地說，這種方法所得到的結(jié)果，是一些能在營養(yǎng)瓊脂上生長的好氧細菌的菌落總數(shù)。